本周分享的是一篇关于多基因预测乳腺癌患者临床预后的文章。

标题：AClinicogeneticPrognosticClassifierforPredictionofRecurrenceandSurvivalinAsianBreastCancerPatients.

作者：ChenTing-Hao,WeiJun-Ru,LeiJason,ChiuJian-Ying,ShihKuan-Hui

DOI：doi:10./fonc..

期刊：FrontOncol,,11:

IF：4.

论文一句话

这篇论文作者对亚洲乳腺癌患者进行了基因组分析，评估了一种包含20个基因的分类器模型，该模型可以将乳腺癌患者分为不同风险组，以预测患者的5年复发可能性。

Fig.1.WorkFlow

论文摘要

乳腺癌是世界各地女性的主要死亡原因，完全手术切除是乳腺癌治疗的金标准，然而患者们的预后经常存在很大的差异，有的患者可能会发生局部或区域性的复发。即使是复发风险会相对较低的5年内未复发的患者，也可能会出现晚期复发。

乳腺癌患者潜在的风险包括年龄、诊断阶段、激素受体状态、基因变异、ER/PR/HER2基因型等因素。此外，很多相关的临床病理变量，如肿瘤大小、淋巴结转移、组织学分级、ER和PR表达、HER2状态(也称为ERBB2)，都是影响预后的因素。其中，基因表达谱已经成为了一个重要的预后指标，并且已经被乳腺癌研究人员广泛研究。目前临床上广泛使用的是OncotypeDX，它是基于21个基因报告复发评分，预测淋巴结阴性患者远处复发的风险，并提供了0到15之间的风险评分，但是主要的数据都是来自白人。因此，在本研究中，作者对亚洲乳腺癌患者进行了基因组分析，评估了一种20个基因分类器模型在将乳腺癌患者分为不同风险组以预测5年复发的临床应用。

建模流程

文章中的Fig1描述了模型的全部构建过程，总结下来有如下几个步骤：

获取临床随访数据

建立遗传模型和临床遗传模型

训练预后模型

作者首先获取到了Amwise数据库的乳腺癌患者数据，这个数医院。纳入研究的患者为腔管型(ER+/PR+/HER2-)。排除以下患者:(i)T4或N3疾病，(ii)术前化疗或放疗，(iii)首次出现远处转移，或(iv)福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)肿瘤样本不足，缺少临床或遗传资料的患者也被排除在外。

作者分别建立了遗传模型和临床遗传模型来作为预后预测模型，其中分别有名患者和名患者由于缺失数据而被排除在外。总的人口学特征如下：

接下来作者开始训练预后模型。遗传和临床遗传模型是用一个交叉验证(LOOCV)策略建立的。二元响应采用带logit函数的Logistic回归(Y=0表示有递归，Y=1表示无递归)，X为预测因子的向量空间。遗传模型的预测因子为20基因面板的剖面图，临床遗传模型的预测因子为20基因面板、手术年龄、淋巴结期和肿瘤期。

通过上述方法作者给出了他们的遗传模型：

下表报告了遗传模型5年随访分析中纳入的患者样本的人口学和临床细节。5年复发研究共使用例样本，其中高危患者例，低危患者例。高危患者平均年龄52.29岁，5年内复发32例(24.6%)。低危患者平均年龄53.58岁，5年内复发10例(4.2%)。表4(a)总结了20基因遗传模型的Cox比例风险结果。年龄、肿瘤分期和LVI状态的差异并未发现对复发风险有显著影响。肿瘤分级具有边缘意义，风险分级对高、低危险组患者有显著影响。

临床遗传学模型的结果与遗传学模型的结果一致。下表总结了用于建立临床遗传学模型的患者随访统计数据，共保留样本例。高危组例(平均年龄55.13岁)，5年复发34例(28.1%)，低危组例(平均年龄52.23岁)，5年复发3例(1.3%)。表4(b)总结了临床遗传模型的Cox比例风险结果。同样，年龄、肿瘤分期和LVI状态对乳腺癌患者的复发没有显著影响。同样，年龄、肿瘤分期和LVI状态对患者乳腺癌的复发没有显著影响，而高风险患者与低风险患者以及肿瘤级别较高的患者的复发危险比显著更高。

结果评价

作者绘制了乳腺切除术后5年随访期间复发高风险和低风险患者的Kaplan-Meier曲线。20个基因分类器成功地确定了腔管型乳腺癌患者的风险组。生存曲线显示，高危险评分患者的生存率低于低危险评分患者。

参考文献

ChenTing-Hao.,WeiJun-Ru.,LeiJason.,ChiuJian-Ying.,ShihKuan-Hui.().AClinicogeneticPrognosticClassifierforPredictionofRecurrenceandSurvivalinAsianBreastCancerPatients.FrontOncol,11(undefined),.doi:10./fonc..

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